TERMES CLÉS
aminoacyl-ARNt synthétase
enzyme qui « charge » les molécules d’ARNt en catalysant une liaison entre l’ARNt et l’acide aminé correspondant
anticodon
séquence de trois nucléotides dans une molécule d’ARNt qui correspond à un codon d’ARNm
ARNt initiateur
chez les procaryotes, appelé fMet-ARNtfMet; chez les eucaryotes, appelé tRNAi : un ARNt qui interagit avec un codon de départ, se lie directement au site P du ribosome et s’associe à une méthionine spéciale pour commencer une chaîne polypeptidique.
boîte CAAT
(GGCCAATCT) séquence essentielle d’un promoteur eucaryote impliquée dans la liaison de facteurs de transcription
boîte riche en GC
(GGCG) séquence non essentielle d’un promoteur eucaryote qui lie des facteurs cellulaires pour augmenter l’efficacité de la transcription ; peut être présente plusieurs fois dans un promoteur.
boîte TATA
séquence du promoteur conservée chez les eucaryotes et les procaryotes, qui contribue à établir le site d’initiation de la transcription
brin complémentaire
brin d’ADN qui spécifie la molécule d’ARNm complémentaire
bulle de transcription
région de l’ADN localement déroulée qui permet la transcription de l’ARNm
en amont
les nucléotides précédant le site d’initiation ; en général, les séquences vers l’extrémité 5′ par rapport à un site sur l’ARNm
boîte octamère
(GGCG) séquence non essentielle d’un promoteur eucaryote qui lie des facteurs cellulaires pour augmenter l’efficacité de la transcription ; peut être présente plusieurs fois dans un promoteur.
brin non-matrice
brin d’ADN qui n’est pas utilisé pour transcrire l’ARNm ; ce brin est identique à l’ARNm sauf que les nucléotides T de l’ADN sont remplacés par des nucléotides U dans l’ARNm
cadre de lecture
séquence de codons triplets dans l’ARNm qui spécifie une protéine particulière ; un déplacement du ribosome d’un ou deux nucléotides dans l’une ou l’autre direction abolit la synthèse de cette protéine
codon
trois nucléotides consécutifs dans l’ARNm qui spécifient l’insertion d’un acide aminé ou l’arrêt de la traduction d’une chaîne polypeptidique pendant la traduction
codon initiateur
AUG sur un ARNm à partir duquel la traduction commence ; spécifie toujours la méthionine
codon non-sens
l’un des trois codons de l’ARNm qui spécifie la terminaison de la traduction
coiffe 7-méthylguanosine
modification ajoutée à l’extrémité 5′ des pré-ARNm pour protéger l’ARNm de la dégradation et faciliter la traduction.
colinéaire
en termes d’ARN et de protéines, trois « unités » d’ARN (nucléotides) spécifient une « unité » de protéine (acide aminé) de manière consécutive.
complexe de préinitiation
groupe de facteurs de transcription généraux et d’autres protéines qui recrutent l’ARN polymérase II pour la transcription d’une matrice d’ADN
consensus
séquence d’ADN utilisée par de nombreuses espèces pour accomplir des fonctions identiques ou similaires.
dégénérescence
(du code génétique) décrit qu’un acide aminé donné peut être codé par plus d’un triplet de nucléotides ; le code est dégénéré, mais n’est pas ambigu.
dogme central
affirme que les gènes spécifient la séquence des ARNm, qui à leur tour spécifient la séquence des protéines
édition de l’ARN
modification directe d’un ou plusieurs nucléotides dans un ARNm déjà synthétisé
en aval
nucléotides suivant le site d’initiation dans le sens de la transcription de l’ARNm ; en général, séquences situées vers l’extrémité 3′ par rapport à un site de l’ARNm
épingle à cheveux
structure de l’ARN lorsqu’il se replie sur lui-même et forme des liaisons hydrogène intramoléculaires entre les nucléotides complémentaires
épissage
processus d’élimination des introns et de reconnexion des exons dans un pré-ARNm
exon
séquence présente dans l’ARNm, codant pour la protéine après l’épissage du pré-ARNm
FACT
complexe qui « facilite la transcription de la chromatine » en désassemblant les nucléosomes avant la transcription de l’ARN polymérase II et en les réassemblant après le passage de la polymérase.
holoenzyme
ARN polymérase procaryote composée de α, α, β, β’ et σ; ce complexe est responsable de l’initiation de la transcription.
intron
les séquences intermédiaires non codantes pour les protéines qui sont épissées à partir de l’ARNm prémessager au cours de la maturation de la l’ARNm
peptidyltransférase
enzyme à base d’ARN intégrée à la sous-unité ribosomale 50S et catalysant la formation de liaisons peptidiques.
petit ARN nucléaire
molécules synthétisées par l’ARN polymérase III qui ont diverses fonctions, notamment l’épissage des pré-ARNm et la régulation des facteurs de transcription
plasmide
molécule d’ADN circulaire extrachromosomique, fermée de manière covalente, qui peut ne contenir qu’un ou quelques gènes ; fréquente chez les procaryotes
polysome
molécule d’ARNm traduite simultanément par de nombreux ribosomes allant tous dans la même direction
promoteur
séquence d’ADN à laquelle l’ARN polymérase et les facteurs associés se lient et initient la transcription.
queue poly-A
modification ajoutée à l’extrémité 3′ des pré-ARNm pour protéger l’ARNm de la dégradation et faciliter l’exportation de l’ARNm hors du noyau.
règles de Kozak
déterminent l’AUG d’initiation correcte dans un ARNm eucaryote ; la séquence consensus suivante doit apparaître autour de l’AUG : 5’-GCC(purine)CCAUGG-3’ ; les bases en gras sont les plus importantes
séquence Shine-Dalgarno
(AGGAGG) ; initie la traduction procaryote en interagissant avec les molécules d’ARNr composant le ribosome 30S
séquence signal
courte queue d’acides aminés qui dirige une protéine vers un compartiment cellulaire spécifique
site d’initiation
nucléotide à partir duquel la synthèse de l’ARNm se fait dans le sens 5′ vers 3′ ; marqué par un « +1 ».
terminaison rho-dépendante
chez les procaryotes, terminaison de la transcription par une interaction entre l’ARN polymérase et la protéine rho au niveau d’une série de nucléotides G sur la matrice d’ADN
terminaison rho-indépendant
arrêt de la synthèse de l’ARNm procaryote dépendant de la séquence de terminaison ; causé par la formation d’une épingle à cheveux dans l’ARNm qui bloque la polymérase
