C02 : L’agression des grenouilles

L’agression des grenouilles

Vous êtes un écologiste comportemental intéressé par la territorialité et l’agression chez les grenouilles. La grenouille venimeuse à cuisses brillantes Allobates femoralis dépend de la présence de petites mares d’eau pour sa reproduction. Les mâles de cette espèce se livrent à une compétition territoriale pour sécuriser les zones qui contiennent ces mares d’eau. On ignore cependant à quel moment du développement des grenouilles le comportement territorial émerge. Pour tester cela, vous avez voyagé jusqu’à un site de terrain en Équateur oriental et capturé 50 A. femoralis de divers stades de développement. Vous avez enregistré le sexe de chaque grenouille, mesuré la longueur du museau au cloaque (SVL ; en mm) de chaque grenouille, puis soumis les grenouilles à un test de miroir. Dans le test de miroir, vous avez enregistré si elles exprimaient des comportements agressifs (par exemple, des charges, des morsures ou des luttes) envers leur reflet dans le miroir.

Note : Ce scénario implique une analyse statistique plus avancée connue sous le nom de “Régression logistique”, non couverte ni par les statistiques descriptives ni par les statistiques inférentielles. Le principe général de la régression logistique est de déterminer si une variable prédictive a un effet sur le résultat d’une variable de réponse catégorielle. Dans ce scénario, notre résultat catégoriel est binaire (pas d’agression, 0, versus agression, 1). Cela fait de ce scénario plus spécifiquement une “Régression binomiale”, qui est un sous-ensemble de la régression logistique. Pour une introduction sur la façon de réaliser une régression binomiale en R, voir :

https://bookdown.org/ndphillips/YaRrr/logistic-regression-with-glmfamily-binomial.html

1. Chargez les données. Imprimez la plage de SVL pour les mâles et la plage de SVL pour les femelles.

2. En utilisant la commande glm() en R, déterminez s’il y a une association entre le sexe ou la taille du corps et le comportement agressif chez ces grenouilles. Ne pas ajuster une interaction entre la taille du corps et le sexe.

3. Pour le sexe et la taille du corps, rédigez une déclaration inférentielle basée sur les résultats de votre modèle de régression binomiale qui inclut à la fois le sexe et la taille du corps.

4. Créez un modèle de régression binomiale en utilisant uniquement SVL comme variable prédictive, et enregistrez-le dans un objet appelé “mod”.

5. En utilisant les graphiques de base de R, tracez les valeurs prédites pour un vecteur de longueurs de museau-cloaque théoriques de 5mm à 30mm, en utilisant le modèle de régression binomiale SVL.
   • Pour un exemple de comment tracer les valeurs prédites de la régression logistique, voir :
     https://www.geeksforgeeks.org/how-to-plot-a-logistic-regression-curve-in-r/

Fichiers à télécharger :

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1. FrogAggro.csv

Laboratoire et Institution ou Investigateur Principal : 

Laboratoire d’Écologie Comportementale et Sensorielle, Dr. James B. Barnett, Département de Zoologie, Trinity College Dublin, Irlande

Références et lectures complémentaires : 

Chaloupka, S., Peignier, M., Stückler, S., Araya-Ajoy, Y., Walsh, P., Ringler, M., & Ringler, E. (2022). Repeatable territorial aggression in a Neotropical poison frog. Frontiers in ecology and evolution, 10, 881387.

Rodríguez, C., Fusani, L., Raboisson, G., Hödl, W., Ringler, E., & Canoine, V. (2022). Androgen responsiveness to simulated territorial intrusions in Allobates femoralis males: evidence supporting the challenge hypothesis in a territorial frog. General and comparative endocrinology, 326, 114046.