Annexe 5 : Liste de référence pour le matériel

Équipement général de laboratoire

• Agitateur pour les gels (sur la paillasse latérale)
• Ordinateurs (1 par groupe) – apportez un ordinateur portatif
• Spectrophotomètre UV-Visible (dans la pièce voisine)
• Vernier Lab Quest 2 et assortiment de sondes (capteur de pH, capteur de pression des gaz, capteur d’oxygène dissous)
• Tampon isolant à 100 °C (dans la hotte de laboratoire)
• Agitateur-mélangeur vortex
• Bonbonne contenant de l’eau Millipore
• Contenant pour objets contaminés pour élimination des déchets de niveau de biosécurité 1
• pH-mètre, étalons, 5 N HCl, 8 N NaOH
• Centrifugeuses (une grande et une petite)
• Balance
• Spatules

Équipement à usage minimal

• Microfluidiseur – Laboratoire central Mehl Demandez de l’aide à l’assistant d’enseignement.
• Tubes pour centrifugeuse haute vitesse (40 ml, réutilisables) (appelés tubes Oak Ridge)
• Plateaux de gel SDS-PAGE, plaques en verre et peignes
• Contenant de stockage en plastique (pour les gels)
• Fioles avec déflecteurs de 250 ml équipées de capuchons à membrane violets
• Bouteilles 1 l et 500 ml, bouteilles et fioles 150 ml
• Fioles Erlenmeyer
• Tubes à culture en verre stérile
• Agitateur
• Pinces pour agitateur

Groupe

• Eau stérile
• Bouts de pipette : 100-1 000 ml, 1-200 ml,
• Support pour tubes à essai Falcon
• 2 boîtes de groupe (une pour conserver à 4 °C et une pour le congélateur à -20 °C)
• Microtubes à centrifugation (1,7 ml et 0,65 ml) en cuves
• Support pour microtubes à centrifugation
• Pipette automatique et chargeur
• Ruban d’étiquetage et marqueur
• Seau à glace (sous la table)
• Ciseaux
• Pissette d’eau Millipore
• Pissette d’éthanol à 95 %
• Récipient d’élimination des déchets
• Récipient d’élimination des liquides
• Ensemble de trois micropipettes (20, 200, 1 000 µl)
• Support pour pipette
• Bec Bunsen et tubulure
• Briquet de bec Bunsen

Tiroirs, étagères et placards communs ou paillasse de fournitures

• Tubes coniques de 50 ml avec couvercle (stériles et non stériles)
• Tubes coniques de 15 ml avec couvercle (stériles et non stériles)
• Pipettes sérologiques de 25 ml
• Pipettes sérologiques de 10 ml
• Pipettes sérologiques de 5 ml
• Support en mousse de polystyrène
• Lames de rasoir
• Tubes Eppendorf stériles en cuves de verre
• Essuie-tout
• Gants
• Ruban de marquage

Produits chimiques (Spécialités, il est possible de substituer les fournisseurs)

• Composants de milieux à auto-induction (adapté de Nature Protocols)
• Bouillon 2x YT (Fisher, BP2467-2)
• Dodécyl sulfate de sodium (Fisher, BP166-100)
• Sel de sodium de bleu de bromophénol (Sigma, B-5525)
• β mercapto-éthanol (Sigma, M7154)
• Coloration bleu de Coomassie brillant G (Sigma, B0770)
• Réactif de dosage protéique Coomassie Bradford (Bio-Rad Quick Start)
• Lysozyme (Fisher, BP535-10)
• Solutions tampons pour pH-mètre (Thomas Scientific, numéros 4120G52, 4120G60, et 4120G68 pour les pH 4, 7, and 10, respectivement)
• Acides aminés non canoniques

Produits chimiques préparés

• Solution d’acrylamide à 30 % pour SDS-PAGE (Bio-Rad, préparée)
• Tampon de migration 10x pour SDS-PAGE, pH 8,3 (préparez 500 ml)
  • o 250 mM de Tris base
  • o 92 M de glycine
  • o 1 % de solution SDS
• Colorant de charge SDS 2x pour SDS-PAGE, pH 6,8 (préparez 10 ml)
  • o 125 mM de Tris HCl
  • o 4 % de solution SDS
  • o 20 % de glycérol
  • o 0,02 % de bleu de bromophénol
  • 5 % de β mercapto-éthanol
• Solution de coloration pour les gels protéiques (les assistants d’enseignement les prépareront)
  • o 250 ml de méthanol
  • o 200 ml d’H₂O
  • o 50 ml d’acide acétique glacial
  • o Coloration bleu de Coomassie brillant G
• Solution de décoloration pour les gels protéiques (les assistants d’enseignement les prépareront)
  • o 250 ml de méthanol
  • o 200 ml d’H₂O
  • o 50 ml d’acide acétique glacial
• 5 M de solution de réserve de NaCl
• 1 M chacune de solution de réserve de phosphate de sodium monobasique et de phosphate de sodium dibasique, ou préparez une solution de réserve de phosphate au pH souhaité.
• Solution d’équilibrage 5x pour purification des protéines, pH 7,0
  • o 250 mM de phosphate de sodium pH 7 (se reporter au tableau de mélange des solutions de phosphate de sodium pour obtenir 0,1 M pH 7 ou utilisez une solution de réserve préparée au pH souhaité)
  • o 5 M de NaCl
• Solution d’équilibrage/de lavage 1x pour purification des protéines, pH 7,0
  • o 50 mM de phosphate de sodium
  • o 300 mM de NaCl
• Tampon d’élution 1x pour purification des protéines, pH 7,0
  • o 50 mM de phosphate de sodium
  • o 300 mM de NaCl
  • o 250 mM d’imidazole